Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms