Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chd1P40201 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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