Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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