Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxc11P31313 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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