Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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