Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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