Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm43413-201ENSMUST00000200411 1566 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Patj-207ENSMUST00000107034 4799 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms