Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb2P13373 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms