Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P10404 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms