Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms