Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 A430033K04Rik-202ENSMUST00000069862 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Hdac5Q9Z2V6 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms