Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf6Q9DBU5 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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