Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ubash3bQ8BGG7 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms