Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pcsk9Q80W65 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pcsk9Q80W65 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms