Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccdc88cQ6VGS5 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Ccdc88cQ6VGS5 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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