Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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NipblQ6KCD5 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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NipblQ6KCD5 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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NipblQ6KCD5 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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NipblQ6KCD5 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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NipblQ6KCD5 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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