Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms