Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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