Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Q3U6N9 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms