Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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