Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sdc2P43407 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sdc2P43407 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms