Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp4P35123 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp4P35123 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms