Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms