Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd9P28357 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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