Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PdgfaP20033 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms