Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms