Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
P10404 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
P10404 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms