Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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