Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms