Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms