Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm8813-201ENSMUST00000155930 595 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim39Q9ESN2 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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