Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
OtofQ9ESF1 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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