Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn23Q9D7D7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms