Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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