Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rab28Q99KL7 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab28Q99KL7 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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