Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Usp27Q8CEG8 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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