Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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