Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms