Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms