Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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