Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Msl2Q69ZF8 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms