Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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