Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms