Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm3654-201ENSMUST00000173038 909 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Mir5135-201ENSMUST00000174997 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Tmem95-201ENSMUST00000178597 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm26817-201ENSMUST00000180446 339 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Stmn1-rs1-201ENSMUST00000214793 462 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 4930477N07Rik-201ENSMUST00000218762 614 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC133087.1-201ENSMUST00000221837 148 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC192434.1-201ENSMUST00000225464 390 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Cox8b-201ENSMUST00000026561 360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Tmx2-201ENSMUST00000053664 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Cep112-206ENSMUST00000130515 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 CT009723.1-201ENSMUST00000215057 1803 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Slco1c1-206ENSMUST00000205214 2515 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Polr2l-201ENSMUST00000043870 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Il12b-201ENSMUST00000102796 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm7444-201ENSMUST00000217455 2428 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm44610-201ENSMUST00000209012 3827 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Slc30a6-202ENSMUST00000179074 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Rpl17-ps8-201ENSMUST00000118924 621 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm15368-201ENSMUST00000120438 858 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm14334-201ENSMUST00000122030 693 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Gm16212-201ENSMUST00000136190 282 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Znf48Q3US17 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms