Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Snx27Q3UHD6 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Snx27Q3UHD6 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms