Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sec24aQ3U2P1 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms