Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Ttc39dQ0VF76 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms