Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ttc21bQ0HA38 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ttc21bQ0HA38 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms