Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SftpdP50404 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms