Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd1P40201 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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